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Sujet du devoir
bonjour :)
jai besoin daide en enzymologie :)
http://biochimej.univ-angers.fr/Page2/TexteTD/2LicenceUE1/1EnzymoBASES/1EnzymoBASES.htm
il s'agit de l'exercice 1 , il y a seulement les trois premieres question à faire
merci d'avance
Où j'en suis dans mon devoir
j'ai les trois premieres question à faire mais je n'y parviens pas
pour la question 1 quand on me demande la vitesse initiale je pense qu'il faut diviser la concentration par le temps mais je ne suis pas sur de moi
c'est a dire : 0.9/2.5
1.9/2.5
3.2/0.9
3.6/0.9
mais une fois avoir fait ces calculs j'ai du mal avec les "traçage " de courbes je en comprend pas tres bien ce quon me demande dans les questions bien que je connaisse tres bien mon cours je ne parviens pas à appliquer ce que j'ai appris
jaimerais donc avoir de l'aide pour parvenir à comprendre cette exercice
merci d'avance
8 commentaires pour ce devoir
2) Grâce au 1) on a calculé 4 vitesses initiales correspondant chacune à une concentration initiale en substrat A.
On peut alors tracer la courbe de saturation : vi = f([S0]).
on a alors 4 points à placer : la vitesse initiale est en ordonnée et la concentration en substrat est en abscisse.
Pour les questions 2) et 3) on parle de paramètres cinétiques à déterminer. Graphiquement je ne vois que Vmax et Km que l'on peut trouver.
Tu as du cours ici qui peut t'aider peut-être :
http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/michaelis-menten/michaelis-menten.html
merci en effet alors j'ai tracé la courbe de saturation jobtiens pareil un courbe croissante comme dan le cours ! merci beaucoup
pour la question 3 , le prof fait une correction oral dune question similaire
il a tracé (1/v) en fonction de (1/[a])
ensuite il a determiné en effet les vmax et km
dapres le lien de votre message , dans le cours il s'agit bien ici de faire l'inverse de v et du susbtrat et si j'ai bien saisis il va y avoir deux intersections une avec l'axe des ordonnées l'autre avec l'axe des abscisses . il s'agit de linverse du km et de la vmax donc il faudra faire l'inverse de lintersections c'est bien cela?
cependant je ne parviens pas à faire l'echelle pour mon graphique j'ai mis tout sur inverse mais je ne trouve pas d'echelle
pour les 1/v j'ai les points suivants :
2.8
1.25
0.8
0.7
pour le susbtrat jai :
1/10 =0.1
1/30=0.003
1.100=0.01
1/150=0.066
Alors oui pour la question 2) et la portion linéaire c'est bien le raisonnement !
Pour le 3) aussi mais je modifie certaines valeurs :
pour les 1/v j'ai les points suivants :
2.8
1.25
0.8
0.7 ici j'ai trouvé pareil
pour le susbtrat jai :
1/10 =0.1
1/30=0.003 non 0,03
1.100=0.01
1/150=0.066 non 0,0066
J'ai essayé de le tracer rapidement.
Comme échelle j'ai pris (sur une feuille petits carreaux) :
abscisse : 0,005 mol-1 pour un petit carreau
ordonnée : 0,2 min/mM pour un petit carreau.
on obtient une droite croissante.
Elle coupe l'axe des ordonnées en un point = 1/Vmax (mon schéma n'est pas très bien fait mais je trouve une intersection entre 0,2 et 0,4).
imaginons qu'on trouve 0,3. alors 1/Vmax = 0,3 et oui il faut prendre l'inverse pour avoir Vmax.
On continue à suivre la droite et elle coupe l'axe des abscisses en un point qui correspond à -1/Km.
Pareil il faudra prendre l'inverse.
Par contre je ne sais pas expliquer la différence trouvée entre les valeurs obtenues avec le 2) et celles du 3).
Pour finir : je n'ai pas la prétention de donner "des instructions" :-).
Quand je pense savoir résoudre un exercice, je propose simplement mon aide ! Après on l'utilise ou pas :)
bonjour :) merci de votre reponse
alors donc jai fais le graphique de saturation .
pour les ordonnées j'ai fais un petit carreaux = 0.1 donc 0.1-0.2-0.3 etc..
pour les abscisses jai fais comme vous c a d un petit careaux =0.005 donc ensuite 0.01-0.015-0.020 donc de 0.005 en 0.005
jobtiens une courbe comme dans le lien qui coupe laxe des absccisse et des ordonnées
pour 1/vmax jobtiens= 0.55 donc si je fais linverse cela me donne vm=1.8
ensuite , pour le -1/km jobtiens : 0.025 donc si je fais linverse cela me donne 40
il me semble que le prof avait mis
km= 45mM
et vm = 1.85
c'est presque similable ? donc c'est correct? :)
ah non instructions je ne vois pas ça comme un ordre du tout ^^ j'ai peut etre pas utilisé le bon terme :-) par instruction je voulais dire votre "protocole " ^^
Les résultats ont l'air de correspondre à ce qu'a donné le professeur.
Sachant qu'avec une détermination graphique, il y a toujours une marge d'erreur cela me paraît très bon signe !
Je pense en tout cas que le raisonnement est bon.
Bonne continuation :-)
ah super merci beaucoup pour votre aide :-)
Ils ont besoin d'aide !
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Bonjour,
Je ne suis pas une spécialiste de l'enzymologie mais je peux te donner mon point de vue et comment j'aurai répondu aux questions.
1) On dit de tracer les cinétiques.
Donc sur un même graphique, j'aurai tracé la Concentration du produit C (en ordonnée) en fonction du temps (en abscisse).
on doit obtenir 4 courbes (1 pour une concentration initiale en substrat A de 10 mM ; une 2ème qui correspond à So = 30 mM ; ...).
Comment déterminer la vitesse initiale pour chacune des courbes :
les courbes sont croissantes et il y a une partie linéaire. La vitesse initiale correspond à la pente ou coefficient directeur de cette droite.
soit on peut calculer cette pente graphiquement soit on utilise les points (temps ; concentration en C) qui appartiennent à cette portion linéaire et on fait le calcul :
vi = différence des concentrations / différence du temps
exemple : on a deux points ( t3 ; C3 ) et (t5 ; C5)
vi = (C5-C3)/(t5-t3)
en tous les cas ce n'est pas juste 0,9/2.5 qu'il faut faire mais bien une différence.
ici quand on fait 0,9/2.5 c'est comme si on faisait une différence par rapport au temps t=0s et ce point n'appartient pas à la portion de droite.
Pour ce qui est de l'eau : j'aurais dit que c'est le solvant qui est toujours mis en large excès et qui n'intervient pas dans la réaction enzymatique.
Quand on substrat, il faut regarder si sa concentration est très grande par rapport à ...
bonjour
merci pour votre reponse
alors jai suivis vos instructions et j'ai réussis a obtenir un graphique avec 4 courbes
les courbes sont comme un arc en ciel c'est a dire elels partent de lorginie sont croissane puis forme un pond du moins ça ressemble au courbe que mon prof fait
seulement je ne comprend pas comment faire pour avoir la vitesse initiale la methode avec les points que vous donnez me semble etre abordable seulement, je ne parviens pas a voir ou est la portion lineaire pour pouvoir prendre les points et faire le calcul
de ec que jai compris pour avoir la portion lineaire il suffit de relié les premiers points entre eux on a donc une ligne droite et on vois qua un certain moment la courbe en forme darc en ciel nest plus en lien avec la courbe lineaire elle devie en quelque sorte ....
du coup je prend donc les points avant que les deux droites se separents c'est bien ça ?
donc j'applique alors pour la courbe 10nm
je prend deux points avant que les deux ligne se separents
je prend donc deux points
(2.5;0.9)(5;1.8)
je prend les points de la portion lineaire mais qui figure dans le tableau de l'énoncé c'est bien ça?
donc (1.8-0.9)/(5-2.5)=0.36 micromol.min^-1
v30nM : 3.9-1.9/(5-2.5)=0.8" " " "
v100= (3.2-6.4)/(2.5-5)=1.28
v150=1.4